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季節性流感如何傳播?有何規律?復旦團隊在Science發文
研究季節性流感的全球傳播模式,對于制定流感防控措施具有重要科學意義。2024年11月8日,復旦大學公共衛生學院余宏杰教授團隊關于季節性流感的全球時空傳播動態及驅動機制的最新研究成果,以“COVID-19 pandemic interventions reshaped the global dispersal of seasonal influenza viruses”為題,在《科學》(Science)雜志上發表。
《科學》(Science)網站,余宏杰團隊發文。本文圖片均為 復旦大學上海醫學院供圖
過去一百年里,全球暴發過多次流感大流行,分別是1918年西班牙H1N1流感、1957年亞洲H2N2流感和1968年香港H3N2流感,以及2009年甲型H1N1流感。
盡管國際科學界在流感的流行病學領域已開展多年深入研究,但遺憾的是,還無法突破關鍵理論和技術以闡釋兩大問題:精確解析流感疫情在全球每年周而復始的發生規律、時空擴散過程及其驅動機制。
復旦大學公共衛生學院余宏杰教授團隊。
面對國際科學難題,余宏杰團隊首先從疾病自然史出發,突破對疫情發生規律的已有認知,解析個體和群體的疾病負擔,最后確定其特異的傳播網絡和演化機制。通過前期的深入研究和積累,余宏杰察覺到,COVID-19大流行給所有呼吸道傳染病研究帶來了“機會”:盡管感染不同呼吸道傳染病病原體誘導的特異性免疫不同,但COVID-19大流行期間所采取的非藥物性干預措施對其傳播的阻斷作用是共通的。
余宏杰重點思考這些問題:COVID-19大流行是否會影響季節性流感的全球傳播和進化動態?可否重塑季節性流感全球傳播和進化的格局?季節性流感何時恢復至大流行前的水平?余宏杰帶領團隊抽絲剝繭、層層深入開展研究。余宏杰的博士研究生陳志元從描述大流行期間全球季節性流感病毒的活動強度入手,不出意外地發現其整體活動水平顯著降低,并且B/Yamagata譜系自2020年3月后似乎“銷聲匿跡”,但伴隨全球針對COVID-19非藥物性干預措施的逐步解除,流感病毒的活動水平又逐漸開始恢復。
COVID-19大流行期間施加的非藥物干預措施打破了季節性流感傳播的“常態”,目前,國際科學界尚未揭示其從“擾亂”到“恢復”的全過程。2023年6月至8月,余宏杰領銜的國際合作團隊重建了COVID-19大流行前、中、后全球季節性流感的傳播模式。
研究聚焦在重建四個時期“大流行前期(2017年1月-2020年3月)、大流行期的急性階段(2020年4月-2021年3月)、大流行期的轉變階段(2021年4月-2023年4月)和大流行后期(2023年5月-2024年3月)”的全球季節性流感傳播動態。余宏杰表示,團隊整合全球流感流行病學監測數據、基因序列數據和人群航空流量數據,將全球分成了12個區域,在貝葉斯系統動力學的框架下重構了四個時期的季節性流感傳播模式,并估計了傳播的相關參數和潛在驅動因素。
全球航空流量變化及在流感傳播中的作用
研究結果發現,季節性流感的活動水平和區域間航空流量均經歷了“下降后恢復”的過程。區域間航空流量往往代表著長距離的人群移動情況。在時間異質性的系統動力學模型框架下進一步結合基因序列數據,團隊發現,區域間航空流量是四個時期全球季節性流感傳播的主要驅動因素。通過估計地理進化樹中的主干區域,發現大流行期間,南亞和西亞分別是維持A型流感和B/Victoria循環的關鍵區域。
為評估大流行期間不同流感季的傳播強度和傳播模式相似性,團隊又進一步運用多維尺度分析方法研究了季節性流感傳播的恢復。研究發現,大流行后期(2023年5月-2024年3月),全球季節性流感傳播的模式和強度已基本恢復至大流行前的水平。
全球季節性流感的傳播動態
本研究識別了全球季節性流感的流行特征和傳播關鍵區域,明確了針對COVID-19的非藥物性干預措施對區域流感病毒進化/循環獨立性的影響,以及大流行后流感傳播模式的穩健恢復以及新型流感毒株起源地的不確定性,強調了加強呼吸道病原體的病毒學和基因監測、及時調整疫苗接種策略和監測方向的重要性。研究結果對未來大流行的綜合應對提供了實證依據,將加深大流行情境下對季節性呼吸道病原體傳播和進化的理解。
《科學》(Science)雜志編輯及審稿人對論文高度評價:“研究結構和內容豐富”、“COVID-19大流行為流感傳播提供的研究視角是獨一無二的”、“研究提供了對季節性流感譜系動力學的最新理解,也定量剖析了大流行期間人群移動模式的變化在全球季節性流感傳播的作用”。
復旦大學公共衛生學院2022級博士生陳志元是此文章的獨立第一作者。復旦大學公共衛生學院教授、上海市重大傳染病和生物安全研究院與復旦大學附屬華山醫院感染病科雙聘PI余宏杰與牛津大學Moritz Kraemer教授、比利時魯汶大學Philippe Lemey教授、皇家獸醫學院Oliver Pybus教授為共同通訊作者。
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