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諾獎2024|解讀:小RNA如何幫助我們理解生命和治療疾???
·幾名專家表示“有些吃驚”,但也表示該結(jié)果在情理之中。這不僅因為安布羅斯與魯弗肯是該領(lǐng)域中無可置疑的先驅(qū),也因為小RNA在基礎(chǔ)研究和臨床診療上的重要性值得第二塊獎牌。
·miRNA(microRNA)是一類長度僅約20~22個核苷酸的小RNA(small RNA)分子,它并不直接參與蛋白質(zhì)的合成,而是通過調(diào)控mRNA影響基因的表達。
北京時間10月7日下午,2024年諾貝爾生理學或醫(yī)學獎在瑞典揭曉。獎項授予維克多·安布羅斯(Victor Ambros)和加里·魯弗肯(Gary Ruvkun),以表彰他們在發(fā)現(xiàn)微小RNA(miRNA)以及探索其在轉(zhuǎn)錄后基因調(diào)控中所起作用的貢獻。
2024年諾獎得主維克多·安布羅斯和加里·魯弗肯在2014年科學突破獎(Breakthrough Prize)頒獎典禮上。近年來二人橫掃生命科學領(lǐng)域的多項大獎。圖片來源:Steve Jennings/Getty Images for Breakthrough Prize
20世紀90年代初,安布羅斯與魯弗肯在研究線蟲時發(fā)現(xiàn)了首個名為lin-4的miRNA,它能夠?qū)α硪粋€基因lin-14進行調(diào)控,使線蟲表達出光滑或者皺褶的皮膚性狀。2000年,魯弗肯發(fā)現(xiàn)了第二個miRNA“l(fā)et-7”,并證明它在動物界中高度保守——即相對穩(wěn)定地出現(xiàn)在不同的物種之間。這表明miRNA是一種廣泛存在的調(diào)控機制。
RNA在遺傳信息的表達中發(fā)揮著重要的功能。細胞核的DNA中儲存著生命的“密碼”,這些遺傳信息通過轉(zhuǎn)錄被復制到“信使”RNA(mRNA)中并被帶到細胞質(zhì),在那里進行蛋白質(zhì)的合成(“表達”),形成生命的構(gòu)造和功能。不同于mRNA,miRNA是一類長度僅約20~22個核苷酸的小RNA(small RNA)分子,它并不直接參與蛋白質(zhì)的合成,而是通過調(diào)控mRNA影響基因的表達。
得益于二人的開創(chuàng)性工作,如今,人們已經(jīng)在包括人在內(nèi)的許多物種中發(fā)現(xiàn)了超過10000種miRNA,它們在胚胎發(fā)育、血細胞分化、肌肉功能、病毒感染和癌癥等生物學過程中都發(fā)揮了不可或缺的作用。此外,多種起重要調(diào)控作用的其它小RNA也陸續(xù)被發(fā)現(xiàn),其中小干擾RNA(siRNA)的相關(guān)研究更是于2006獲得了諾貝爾獎。
為什么小RNA如此重要,以至于在30年間獲2次諾獎?它們是如何產(chǎn)生,又是如何進行基因調(diào)控的?對于疾病治療和藥物開發(fā)有何意義?未來的研究方向在哪里?10月7日晚,澎湃科技邀請了多位領(lǐng)域內(nèi)專家進行解讀。
意料之外又實至名歸:小RNA有大作用
對于自2006年以來小RNA領(lǐng)域第二次獲諾獎,幾名專家表示“有些吃驚”,但也表示該結(jié)果在情理之中。這不僅因為安布羅斯與魯弗肯是該領(lǐng)域中無可置疑的先驅(qū),也因為小RNA在基礎(chǔ)研究和臨床診療上的重要性值得第二塊獎牌。
小RNA泛指那些含有較少核苷酸序列(小于200個)的RNA分子,miRNA是其中之一。它是DNA轉(zhuǎn)錄的產(chǎn)物——首先在細胞核中被轉(zhuǎn)錄成一種長鏈的初級形態(tài),隨后被加工成具有特定結(jié)構(gòu)的前體miRNA,接著在細胞質(zhì)中被進一步切割為更小的RNA分子。然而,它接下來卻會承擔“與眾不同”的工作。
“RNA的主要功能被認為是作為“模板”來翻譯蛋白質(zhì)?!?strong>中國科學技術(shù)大學生命科學學院教授光壽紅告訴澎湃科技,“而他們(本屆獲獎?wù)撸┑墓ぷ鞯谝淮伟l(fā)現(xiàn),有一種非常小的RNA,能夠起調(diào)控作用,而不是用來翻譯成蛋白質(zhì)。這在概念上的突破是非常大的?!?/p>
這類不被用來翻譯成蛋白質(zhì)的RNA被稱為“非編碼”RNA。除了非編碼特性之外,人們很快發(fā)現(xiàn),其調(diào)控功能對生物的影響廣泛而深刻。
DNA中的遺傳信息就像一幅建筑“藍圖”,基因調(diào)控就類似于要決定在何時、從哪里開始、用多少材料和人手去建造。調(diào)控可以發(fā)生在轉(zhuǎn)錄前后的各個階段,而miRNA的作用通常是在mRNA上對某些基因表達進行抑制。
“如果我們說基因調(diào)控有兩大類的調(diào)控因子,一類負責‘做加法’,從無到有決定基因是否表達,那么另一類就是miRNA這樣的,負責做“減法”,精確微調(diào)基因的表達,使之穩(wěn)定在某個水平上,或者是直接快速把基因‘關(guān)掉’。”中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心研究員吳立剛介紹道,“這么想的話,這個小家伙是特別重要的。”
miRNA通過一系列精巧的步驟來讓特定基因保持“沉默”。通過與一類Ago(Argonaute)蛋白相結(jié)合,miRNA就能形成一種“RNA誘導沉默復合體”(RISC)。在RISC中,miRNA充當向?qū)?,通過與目標mRNA的核苷酸序列進行互補配對來‘對暗號’,從而識別需要調(diào)控的mRNA序列并與其結(jié)合。
“在結(jié)合之后,(RISC)可以催化目標mRNA切割,導致mRNA的降解和基因表達的沉默。還可以通過阻止核糖體的結(jié)合或干擾翻譯過程來抑制mRNA翻譯成蛋白質(zhì)。”上??萍即髮W生命科學與技術(shù)學院副教授劉如娟解釋道。
這種調(diào)控為很多基本的生命過程提供了保障。科學家們發(fā)現(xiàn),若通過敲除Ago蛋白基因的方式來使miRNA無法形成RISC并進行調(diào)控,那么胚胎發(fā)育、血液細胞分裂等活動便會無法完成。肝癌、心血管等疾病也被發(fā)現(xiàn)與miRNA調(diào)節(jié)異常有關(guān)——在一些研究中,患者體內(nèi)的miRNA數(shù)量與健康者有顯著區(qū)別。
miRNA調(diào)控對于基因的影響不僅巨大,而且廣泛?!癿iRNA調(diào)控不是‘一對一’的,是‘一對多’或‘多對多’的,能同時調(diào)控很多基因?!眳橇傉f,“現(xiàn)在如果要為任何一個生物學過程繪制基因調(diào)控的網(wǎng)絡(luò)圖,總是會發(fā)現(xiàn)有miRNA處在中間一個非常重要的位置上?!?/p>
此外,miRNA是真核生物內(nèi)源產(chǎn)生的,且以比較穩(wěn)定和獨特的形式存在于哺乳動物、昆蟲和植物體內(nèi),這意味著在漫長的進化過程中這種調(diào)控機制因其重要性被保留了下來?!皫缀跛姓婧松镏?,除了釀酒酵母等極少數(shù)物種,都發(fā)現(xiàn)了這種保守的調(diào)控機制,非常廣譜?!?strong>復旦大學生命科學學院研究員任國棟說。
基礎(chǔ)研究待突破,應(yīng)用潛力巨大
30年來,小RNA的生物功能和機制被不斷揭示。比如,人們發(fā)現(xiàn)miRNA不僅有表達抑制和降解作用,也能夠在某些情況下激活基因表達。最近還有研究發(fā)現(xiàn),miRNA或許能夠跨界調(diào)控——比如動物通過攝入植物中的miRNA來影響自身基因表達。
受訪專家都認為,小RNA的研究框架已經(jīng)相對確定,相關(guān)生物機制已經(jīng)“研究得比較清楚了”。
“從2000年這個領(lǐng)域引起大量關(guān)注開始,大家基本上最關(guān)心三類問題。首先是細胞中都有哪些類型的小RNA,其次是小RNA如何調(diào)控基因表達,最后是小RNA與疾病的關(guān)系以及在治療上的應(yīng)用。”吳立剛說,“第一和第二個問題中的一些常見功能和機制,現(xiàn)在已經(jīng)基本解決了?!?/p>
光壽紅認為,探索新的小RNA類型是基礎(chǔ)研究突破的關(guān)鍵點之一。除了miRNA之外,目前狹義的小RNA家族中還有siRNA與piRNA(Piwi相互作用RNA),它們的來源和性質(zhì)均有所區(qū)別。不同于miRNA,siRNA通常是一種外源性小RNA,是一種更為有效的基因沉默機制。而piRNA不與Ago蛋白結(jié)合,而是與Piwi蛋白家族結(jié)合,主要出現(xiàn)在生殖細胞中。
“過去一些年,大家還發(fā)現(xiàn)了一些新的非編碼RNA或者是屬于RNA的修飾。任何一個這種新形式的發(fā)現(xiàn),都會開創(chuàng)新的領(lǐng)域。”光壽紅說。
此外,要更加準確地解釋小RNA的生物學機制,比如描述這些小RNA具體在細胞的哪個位置發(fā)揮功能,還需要對生物檢測方法和工具進行突破。
“現(xiàn)在高通量測序解決了miRNA檢測的大部分問題,但是對于非常微量和非常精確的定量檢測,現(xiàn)在還沒有完全解決?!眳橇傉f,“在單細胞甚至亞細胞水平對miRNA進行轉(zhuǎn)錄組測序,不僅實驗操作非常復雜,而且經(jīng)常因為靈敏度不夠而檢測不到或者無法準確定量,更不用說在亞細胞結(jié)構(gòu)層面上去研究實時追蹤miRNA的定位、組裝與運輸了,這些都有待于新的技術(shù)突破?!?/p>
對于小RNA在醫(yī)療等領(lǐng)域的應(yīng)用,受訪專家均表示與基礎(chǔ)研究相比,還有很大的發(fā)掘空間。
miRNA由于調(diào)控基因較多、較為不穩(wěn)定、修飾易引發(fā)功能改變且難以遞送到特定靶點進行表達,因此成藥性較差,目前還沒有藥物面世。但是,由于它在疾病過程中的表達會發(fā)生變化,能夠被用來當做診斷的指標。
“熱門方向可能還是去開發(fā)各種試劑盒,基于miRNA做疾病診斷?!惫鈮奂t說。
而siRNA已經(jīng)在藥物開發(fā)中取得了驕人成果,它能夠針對特定mRNA發(fā)動沉默效果,對于某些遺傳性疾病和蛋白質(zhì)過表達引起的疾病提供有效的治療。目前,美國FDA(食品藥品監(jiān)督管理局)已經(jīng)批準了6款siRNA藥物。
“小RNA是整個RNA研究中的一顆‘明珠’,因為它的調(diào)控功能特別強大和重要,成藥性和應(yīng)用價值也好?!?strong>中國科學院大學杭州高等研究院副研究員王鑫說,“雖然不知道會不會再次得諾獎,但肯定會有越來越多的小RNA藥物和療法出現(xiàn),以造福人類。”
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