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“系統(tǒng)生物學(xué)之父”胡德:大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的健康將革新醫(yī)療范式
·“利用每個(gè)人的基因組學(xué)圖譜和表型組學(xué)測量來生成一個(gè)獨(dú)特的‘可操作的可能性’列表。在大多數(shù)情況下,這些積極主動(dòng)的行為,經(jīng)過臨床研究驗(yàn)證,將優(yōu)化健康,或防止/阻止軀體和大腦從健康向疾病的演變。當(dāng)疾病演化發(fā)生時(shí),全面的、整體的和數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的方法將為精準(zhǔn)醫(yī)療應(yīng)對(duì)提供信息,即利用大規(guī)模數(shù)據(jù)分析為每個(gè)個(gè)體提供有效的治療建議。”
“醫(yī)療健康的發(fā)展已經(jīng)來到一個(gè)臨界點(diǎn)。在過去以疾病為中心的醫(yī)療模式之下,我們針對(duì)疾病的癥狀進(jìn)行治療,這種模式存在巨大局限性。實(shí)際上,疾病很早就已經(jīng)出現(xiàn)了。現(xiàn)在我們有機(jī)會(huì)在疾病發(fā)病前就把它檢測出來,在它還沒有造成人體的損傷時(shí)就把它解決掉。我們現(xiàn)在有能力改變現(xiàn)有的醫(yī)學(xué)模式,轉(zhuǎn)換成新的范式。如今我們可以獲得豐富的資源,利用大規(guī)模人群隊(duì)列的數(shù)據(jù)來提供令人信服的證據(jù),持續(xù)推進(jìn)醫(yī)療保健的改革。”
2024年9月7日,由中華人民共和國科學(xué)技術(shù)部和上海市人民政府共同主辦的2024年浦江創(chuàng)新論壇(第十七屆)在張江科學(xué)會(huì)堂舉行,美國國家科學(xué)院、美國國家工程院、美國國家醫(yī)學(xué)院、美國藝術(shù)與科學(xué)院四院院士及中國科學(xué)院外籍院士勒羅伊·胡德(Leroy Hood,曾用中文譯名萊諾·伊·胡德)在會(huì)議期間接受媒體采訪時(shí)表達(dá)了上述觀點(diǎn)。
在當(dāng)日舉行的“國際人類表型組:表型組與精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)”專題論壇上,國際人類表型組計(jì)劃系列叢書《科學(xué)驅(qū)動(dòng)的全面健康時(shí)代》首次發(fā)布。該書的作者是胡德和美國系統(tǒng)生物學(xué)研究所教授、Thorne HealthTech公司首席科學(xué)官內(nèi)森·普賴斯(Nathan Price)。
胡德是自動(dòng)DNA測序技術(shù)的領(lǐng)軍人物之一。1986年,他發(fā)明了世界上第一臺(tái)DNA自動(dòng)測序儀,這個(gè)機(jī)器使人類基因組測序成為了可能,從而催生了基因時(shí)代。他還開發(fā)了一系列突破性科學(xué)儀器,包括第一臺(tái)氣相蛋白質(zhì)測序儀(1982年)、DNA合成儀(1983年)、肽合成儀(1984年)等。20世紀(jì)80年代,因?yàn)樵诿庖叨鄻有苑矫娴难芯浚@得了被稱為“諾獎(jiǎng)風(fēng)向標(biāo)”的拉斯克基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究獎(jiǎng)。他也是人類基因組計(jì)劃的關(guān)鍵人物之一,他認(rèn)為,表型組研究能帶來大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的健康,最終實(shí)現(xiàn)早期預(yù)防、個(gè)性化治療的目標(biāo)。
《科學(xué)驅(qū)動(dòng)的全面健康時(shí)代》。主辦方供圖
從“以疾病為中心”到“以健康為中心”
胡德被譽(yù)為“系統(tǒng)生物學(xué)之父”。近年來,他提出了“P4醫(yī)學(xué)”的概念,即一種預(yù)測性(predictive)、預(yù)防性(preventive)、個(gè)性化(personalized)和參與性(participatory)的醫(yī)學(xué)——這是他對(duì)未來醫(yī)學(xué)的愿景。“我們的身體是一個(gè)‘集合了眾多系統(tǒng)的系統(tǒng)’(system of systems),疾病在身體某處引起的異常反應(yīng)可能會(huì)導(dǎo)致另一區(qū)域看似不相關(guān)的問題。將人體狀態(tài)二元分類為‘健康’(不需要醫(yī)療服務(wù))或‘疾病’(需要醫(yī)療服務(wù))對(duì)我們并沒有什么好處。然而,這恰恰是如今醫(yī)療保健系統(tǒng)的構(gòu)建方式。”胡德在書中寫道。
在書中,胡德提出了“科學(xué)驅(qū)動(dòng)的全面健康”的理念,將人體視為一個(gè)復(fù)雜的而又內(nèi)在相互關(guān)聯(lián)的整體,通過現(xiàn)代科技的人體精密測量技術(shù)收集縱向、動(dòng)態(tài)的數(shù)據(jù),生成個(gè)人的密集動(dòng)態(tài)數(shù)據(jù)云,通過人群數(shù)據(jù)與個(gè)人數(shù)據(jù)來開發(fā)個(gè)性化健康方案。
這將引領(lǐng)醫(yī)療保健系統(tǒng)向“以健康為中心”轉(zhuǎn)變,產(chǎn)生一種新的醫(yī)療標(biāo)準(zhǔn)。“利用每個(gè)人的基因組學(xué)圖譜和表型組學(xué)測量來生成一個(gè)獨(dú)特的‘可操作的可能性’列表。在大多數(shù)情況下,這些積極主動(dòng)的行為,經(jīng)過臨床研究驗(yàn)證,將優(yōu)化健康,或防止/阻止軀體和大腦從健康向疾病的演變。當(dāng)疾病演化發(fā)生時(shí),全面的、整體的和數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的方法將為精準(zhǔn)醫(yī)療應(yīng)對(duì)提供信息,即利用大規(guī)模數(shù)據(jù)分析為每個(gè)個(gè)體提供有效的治療建議。”胡德寫道。
但實(shí)現(xiàn)這種愿景是非常困難的,胡德并不諱言這一點(diǎn),“如果不困難,就不會(huì)是革命性的。”他在書中指出,“P4醫(yī)學(xué)”的前3個(gè)“P”是由科學(xué)驅(qū)動(dòng)的,而第4個(gè)“P”,即參與性,是心理學(xué)、社會(huì)學(xué)和經(jīng)濟(jì)學(xué)上的挑戰(zhàn),亦是“21世紀(jì)醫(yī)學(xué)面臨的最大挑戰(zhàn)”。他相信,實(shí)現(xiàn)這種愿景所必需的主要行動(dòng)將在未來15-20年內(nèi)完成。
在接受媒體采訪時(shí),胡德呼吁加強(qiáng)科學(xué)研究的國際交流與合作。“健康應(yīng)該是普羅大眾的,是每個(gè)人都應(yīng)該享受的權(quán)利。所以應(yīng)該盡可能地交換關(guān)于健康科研的信息,這樣能夠有效地促進(jìn)和改變每個(gè)人的健康狀態(tài)。在健康這樣的科學(xué)議題上,各國政府應(yīng)當(dāng)加強(qiáng)合作,促進(jìn)交流,來加速數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的巨大的健康機(jī)遇。”
國際人類表型組研究的中國進(jìn)展
國際人類表型組研究計(jì)劃是實(shí)現(xiàn)“以健康為中心”的醫(yī)療保健體系的重要路徑之一。2018年,復(fù)旦大學(xué)校長金力院士、胡德院士、英國醫(yī)學(xué)科學(xué)院院士杰里米·尼克爾森(Jeremy Nicholson)共同在上海發(fā)起了國際人類表型組研究協(xié)作組,標(biāo)志著人類表型組國際大科學(xué)計(jì)劃在科學(xué)界實(shí)質(zhì)性啟動(dòng)。目前,已有來自20個(gè)國家的24位領(lǐng)軍學(xué)者團(tuán)隊(duì)加入。
據(jù)了解,表型組是指生物體從胚胎發(fā)育到成長、衰老、死亡過程中所有生物學(xué)性狀的集合,是基因與環(huán)境及兩者互作的產(chǎn)物。人類表型組是人類基因組之后揭示人類生命奧秘的又一關(guān)鍵,人類表型組計(jì)劃的最重要目標(biāo)就是對(duì)大規(guī)模人群隊(duì)列開展跨尺度、全周期的人體系統(tǒng)精密測量,來探尋疾病與環(huán)境、表型之間的關(guān)聯(lián),“拼出”全人類的生命奧秘的完整“拼圖”,創(chuàng)造改善人類健康的新范式。
金力在為《科學(xué)驅(qū)動(dòng)的全面健康時(shí)代》所作的序中介紹了中國的表型組研究進(jìn)展:“我們在上海市的支持下,經(jīng)過5年的布局與發(fā)展,建成了全球首個(gè)跨尺度、多維度、一站式人類
表型組精密測量平臺(tái),可一站式集成測量從微觀的蛋白質(zhì)組、代謝組、核酸組、細(xì)胞組到宏觀的生物醫(yī)學(xué)影像、人體外觀、皮膚、睡眠、生物電、心理等二十三類不同尺度的表型。利用表型組精密測量平臺(tái),我們完成了全球第一個(gè)覆蓋表型指標(biāo)最多、規(guī)模最大的健康人群表型組學(xué)縱向隊(duì)列,已有超過千人每人接受測量了超2.4萬個(gè)表型指標(biāo)。基于這個(gè)自然人群深度表型組隊(duì)列數(shù)據(jù),我們繪制出第一張人類表型組導(dǎo)航圖,發(fā)現(xiàn)150余萬個(gè)表型之間的強(qiáng)關(guān)聯(lián),其中約39%為跨尺度關(guān)聯(lián),且大部分是科學(xué)界首次發(fā)現(xiàn)。這張全景導(dǎo)航圖可以為表型組學(xué)研究提供大量多維度、跨尺度的關(guān)聯(lián)信息,指導(dǎo)新型表型調(diào)控機(jī)制的發(fā)掘與驗(yàn)證。在我們推進(jìn)中國人群表型組研究工作的同時(shí),中方團(tuán)隊(duì)還研發(fā)了全球第一套多組學(xué)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)‘中華家系1號(hào)’,開創(chuàng)了生物醫(yī)學(xué)‘度量衡’新體系,為全球推進(jìn)人類表型組計(jì)劃奠定堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。”
對(duì)于大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)健康的模式,公眾可能生發(fā)的一個(gè)疑問是:如何確保數(shù)據(jù)流通的安全性?胡德告訴澎湃科技,研究者主要從參與試驗(yàn)的個(gè)體中收集兩類數(shù)據(jù),一類是基因組數(shù)據(jù),它是公認(rèn)的敏感數(shù)據(jù),可以直接定位到個(gè)人。另一類是表型組數(shù)據(jù),它們不是很敏感的數(shù)據(jù)。2015年到2019年,他創(chuàng)立了一家公司,招募到了5000名的試驗(yàn)參與者,收集了他/她們的基因組和表型組數(shù)據(jù),形成了一個(gè)數(shù)據(jù)庫。他們采用的方法是把數(shù)據(jù)與個(gè)體本身分離,即“去標(biāo)簽化”,再進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,然后把分析結(jié)果返回給醫(yī)生。除了醫(yī)生,沒有人知道這些數(shù)據(jù)是誰的。因此,對(duì)于保護(hù)數(shù)據(jù)安全,胡德提出了兩種方式:去標(biāo)簽化,以及良好的安全系統(tǒng)——一個(gè)能夠防止99%以上入侵的系統(tǒng)。“這也是中國的團(tuán)隊(duì)正在做的。”
該書的譯者之一、上海國際人類表型組研究院數(shù)字健康研究所執(zhí)行所長丁國徽在該書的前言中介紹,其團(tuán)隊(duì)以國際人類表型組計(jì)劃一期產(chǎn)生的數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),構(gòu)建人類表型組通用數(shù)據(jù)模型,制定良好的數(shù)據(jù)治理規(guī)范,為健康數(shù)據(jù)交互和質(zhì)量控制提供解決方案,并已經(jīng)根據(jù)安全合規(guī)的要求,推動(dòng)數(shù)據(jù)要素化人群生物數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)體系和安全機(jī)制建設(shè),設(shè)計(jì)了下一代生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)基礎(chǔ)設(shè)施。
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