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因斯布魯克大學(xué)研究發(fā)現(xiàn)精神分裂癥干細(xì)胞模型中的關(guān)鍵網(wǎng)絡(luò)
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作者:小欣博士
2024年4月29日,奧地利因斯布魯克大學(xué)Frank Edenhofer團隊在Molecular Psychiatry發(fā)表“Integrative metabolomics-genomics analysis identifies key networks in a stem cell-based model of schizophrenia”(https://doi.org/10.1038/s41380-024-02568-8)揭示了綜合代謝組學(xué)-基因組學(xué)分析確定了精神分裂癥干細(xì)胞模型中的關(guān)鍵網(wǎng)絡(luò)。
精神分裂癥(SCZ)是一種神經(jīng)精神疾病,由遺傳和環(huán)境因素的組合因素引起。盡管有研究表明它與對多巴胺和谷氨酸等神經(jīng)遞質(zhì)的異常反應(yīng)有關(guān),但該疾病背后的病因尚不明確。在本研究中,作者旨在探索基于患者來源的誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSCs)的SCZ模型中轉(zhuǎn)錄組和代謝組之間的相關(guān)性。為此,誘導(dǎo)多能干細(xì)胞向皮質(zhì)神經(jīng)元分化,并在不同的發(fā)育階段采集樣本,通過RNA測序和靶向代謝組學(xué)對樣本進行分析。作者觀察到SCZ樣品中谷氨酸脫羧酶編碼基因GAD1和GAD2及其蛋白產(chǎn)物GAD65/67及其生化產(chǎn)物GABA的下調(diào)。鳥氨酸脫羧酶的抑制導(dǎo)致了GABA水平的進一步下降,這表明鳥氨酸/腐胺途徑的代償性激活是GABA產(chǎn)生的另一種途徑。這些發(fā)現(xiàn)表明,在SCZ的早期神經(jīng)發(fā)育階段,發(fā)生了皮質(zhì)興奮性/抑制性動力學(xué)失衡。
圖一 SCZ和對照iPSC細(xì)胞系的體外皮質(zhì)分化和取樣
將受影響患者的成年體細(xì)胞重編程為誘導(dǎo)多能干細(xì)胞,采用各種方法進行疾病建模。從神經(jīng)元分化的6個時間點中提取樣本。在誘導(dǎo)多能干細(xì)胞階段(第0天;d0天),細(xì)胞表達多能性標(biāo)記物,表現(xiàn)出誘導(dǎo)多能干細(xì)胞的特征形態(tài)。隨后,通過暴露于神經(jīng)誘導(dǎo)介質(zhì)(NIM),細(xì)胞被引導(dǎo)形成一個緊密排列的神經(jīng)上皮片(NES)樣結(jié)構(gòu),其中包含調(diào)節(jié)WNT和TGFβ通路的小分子。在該階段存在的神經(jīng)祖細(xì)胞(NPCs)表達SOX1和SOX2(d7)。用FGF2短時間處理后,NPC群體的擴增產(chǎn)生了增殖標(biāo)記物Ki67和神經(jīng)干細(xì)胞標(biāo)記物PAX6。有趣的是,在d50-100之間觀察到的神經(jīng)元中谷氨酸能標(biāo)記物囊泡谷氨酸轉(zhuǎn)運體1(vGLUT1)和谷氨酸脫羧酶65/67(GAD65/67)均呈陽性。
圖二 集成轉(zhuǎn)錄組代謝分析
作者對來自皮質(zhì)分化的樣本進行了定量的靶向代謝組學(xué)分析評估SCZ依賴的代謝異常。為了評估皮質(zhì)分化過程中的代謝組學(xué)動態(tài),進行了短時間序列表達(STEM)模式時間分析。圖譜顯示,在SCZ樣本中總共富集了25個代謝物。對皮質(zhì)分化過程中代謝物的STEM模式分析顯示,對照組和SCZ組的下降軌跡顯著富集。可以根據(jù)基因表達水平和代謝豐度的變化來研究皮質(zhì)分化不同發(fā)育階段的全局分子變化。
圖三 SCZ樣本中GABA生物合成途徑的改變
作者通過靶向LC-MS分析,更全面地探索了SCZ樣本中GABA的失調(diào)。此外,為了研究腐胺在SCZ GABA生物合成中的作用,使用依氟烏氨酸(DFMO)進行細(xì)胞治療,DFMO是一種干擾腐胺生物合成的ODC1抑制劑。與對照組相比,觀察到SCZ細(xì)胞系中的GABA水平僅略有降低。然而,DFMO處理導(dǎo)致SCZ樣品和上清液中GABA水平明顯降低,而對照品系不受影響。這一結(jié)果表明,SCZ系的GABA生物合成更容易依賴于非典型的腐胺途徑。與SCZ樣本相比,對照細(xì)胞系中的谷氨酸顯著降低,獨立于DFMO處理。作者對同時使用對照和SCZ細(xì)胞培養(yǎng)的d27樣本進行了ICC染色。發(fā)現(xiàn)與對照組相比,SCZ樣本中的GAD65/67明顯降低。
綜上所述,作者采用了一個基于iPSC的神經(jīng)元分化模型來研究SCZ病理中的早期神經(jīng)發(fā)育缺陷。研究闡明了GABA失調(diào)和體外神經(jīng)發(fā)育早期的代償機制的參與,暗示了興奮/抑制回路的早期失衡。作者的發(fā)現(xiàn)將有助于加深對SCZ和其他精神疾病的理解,并有可能為開發(fā)新的治療干預(yù)措施奠定基礎(chǔ)。
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