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追問|華東師大團隊《細胞》子刊發布降解致病蛋白新技術

澎湃新聞記者 姚易琪
2024-03-15 07:34
來源:澎湃新聞
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·ΔTrim-TPD技術最突出的優勢在于:它的高度精準可控性和模塊化設計,使得TPD技術的應用更為靈活和廣泛。該技術還實現了高達80%的蛋白降解效率,分鐘級別的降解速度和靈活的調控方式。

我們能精準找到那些出錯的蛋白質嗎?

一種被稱為“靶向蛋白質降解”(targeted protein degradatio,TPD)的技術,它就像是給我們的細胞裝上一個精準的“導航系統”,能夠直接找到并清除那些引起疾病的錯誤蛋白質。

3月12日,華東師范大學生命科學學院研究員葉海峰團隊帶來一個名為ΔTrim-TPD的新型靶向蛋白質降解系統。相關論文發布在《細胞》(Cell)雜志子刊——《Molecular Cell》上。

近日,葉海峰在接受澎湃科技采訪時介紹,這項技術最突出的優勢在于:它高度精準的可控性和模塊化設計,使得TPD技術的應用更為靈活和廣泛。此外,該技術還實現了高達80%的蛋白降解效率,分鐘級別的降解速度和靈活的調控方式。

新技術應用范圍更廣

TPD技術正在不斷發展,但還面臨很多挑戰。一方面,目前廣泛使用的蛋白質降解劑雖然在清除特定蛋白質方面非常有效,但它們可能不夠“挑剔”,有時候也會誤傷那些正常的、對身體有益的蛋白質。此外,有些蛋白質降解技術需要在開始工作之前對目標蛋白質進行特殊的“標記”處理,這一額外的步驟限制了它們的應用范圍,因為并不是所有的蛋白質都容易或適合被這樣處理。

針對這些挑戰,葉海峰團隊開始研究如何突破這些掣肘。據他介紹,ΔTrim-TPD的設計靈感來源于一項早期的技術——Trim-Away,這種技術通過向細胞內注射特定的抗體,實現對病態蛋白質的精準“定位”,并借助一種叫做E3泛素連接酶的“天然剪刀” Trim21 來“剪切”并清除這些蛋白質,“Trim-Away技術的一個突出優點是它不需要對目標蛋白進行任何預處理就能實現降解,而且通過選擇不同的抗體,它幾乎可以針對任何蛋白質進行操作。”

“不需要對目標蛋白進行任何預處理”,這使得這項技術可以應用于幾乎所有類型的蛋白質,不論是內源性的還是外源性的。這極大地擴展了其在生物醫學研究和疾病治療中的應用潛力,不僅簡化實驗流程,還增加了治療策略的可行性。

“特別是腫瘤、病毒感染、代謝性疾病和心血管等疾病,都與特定蛋白質的異常表達有關。ΔTrim-TPD技術能夠精確降解這些關鍵蛋白,為治療這類疾病提供新的策略?!比~海峰說道,但盡管治療應用廣泛,ΔTrim-TPD技術對于一些不可溶的蛋白聚集體降解效果有限,“這可能會限制其在神經退行性疾病方面的應用。”

至于ΔTrim-TPD是否會推動TPD技術走向臨床應用,葉海峰說,盡管TPD技術在生物醫學研究中展現出巨大潛力,但其在臨床應用中的廣泛應用仍面臨諸多挑戰,包括特異性和選擇性問題、藥物遞送和穩定性問題、監管和倫理考慮等。

助力TPD技術走向臨床

據葉海峰介紹,ΔTrim-TPD技術作為一種新興的TPD方法,有潛力在以下幾個方面提供改進,從而推動TPD技術向臨床應用邁進:首先,通過利用特異性高的抗體和改進的E3泛素連接酶,ΔTrim-TPD可能更精確地靶向疾病相關蛋白,減少對非目標蛋白的影響。其次,ΔTrim-TPD能夠減少對蛋白質預處理和復雜化學修飾的需求,它可能簡化藥物的設計和生產過程,加速從實驗室到臨床的轉化。同時,通過光控或化學小分子控制的策略,為精確調控治療提供可能,可以增強治療的安全性和有效性。

當然,這一技術的開發研究過程中挑戰重重。在葉海峰看來,最大的難點就是:如何在不減少對靶蛋白降解效果的同時,引入不同的調控方式(如光調控和化學小分子調控),并實現分鐘級別的快速降解。

為達到這一目的,研究人員首先進行Trim21蛋白的改造和篩選,當獲得最優版本 ΔTrim21之后,又進行了幾十種調控方案的設計,在細胞內進行動力學驗證,并優化了系統的組成。最終開發出了能夠在不犧牲降解效果的前提下,通過不同調控方式實現分鐘級快速降解的三種ΔTrim-TPD系統。

至于ΔTrim-TPD未來的研究方向,葉海峰表示,可能會集中在增強特異性和降解效率,擴展靶蛋白范圍,臨床適應性研究三個方面。雖然ΔTrim-TPD已經展示了高效的蛋白質降解能力,但進一步提高其對特定靶蛋白的特異性和降解效率仍是研究的重點。且目前的ΔTrim-TPD技術可能只驗證了一部分蛋白的降解效果。未來的蛋白研究范圍可能會擴展至那些傳統上被認為“不可成藥”的蛋白質。

“臨床適應性研究方面,將ΔTrim-TPD技術轉向臨床應用是一個重要的努力方向,這包括評估其在動物模型和最終在人類中的安全性、有效性,以及尋找適合人體使用的組織特異性遞送系統?!比~海峰告訴澎湃科技。

    責任編輯:盧雁
    圖片編輯:蔣立冬
    校對:張亮亮
    澎湃新聞報料:021-962866
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