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《自然》:首次全基因組關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)“長新冠”也有易感基因

實(shí)習(xí)生 華嘉俐 澎湃新聞?dòng)浾?曹年潤
2023-07-14 18:41
來源:澎湃新聞
? 生命科學(xué) >
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·研究人員使用來自16個(gè)國家的6450名長新冠患者的數(shù)據(jù),找到了與長新冠相關(guān)的FOXP4基因(Forkhead Box P4,一種肺癌基因),該基因在肺部和其他器官及一些免疫細(xì)胞中活躍。

·“這項(xiàng)研究仍然是一個(gè)突破,未來的研究可能會(huì)增加已知的長新冠的遺傳風(fēng)險(xiǎn)因素列表。”

“長新冠”(long COVLD)的生物學(xué)機(jī)制尚不清楚,科學(xué)家一直不遺余力地尋找其發(fā)病因素。近日,瑞典卡羅林斯卡研究所(Karolinska Institute)等研究團(tuán)隊(duì)在對數(shù)千名患者的全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)中發(fā)現(xiàn)了與長新冠相關(guān)的基因。不過,有專家認(rèn)為這并不是唯一的答案。

當(dāng)?shù)貢r(shí)間7月11日,據(jù)《自然》(Nature)雜志報(bào)道,全基因組關(guān)聯(lián)分析尋找長新冠遺傳風(fēng)險(xiǎn)因素的研究取得了重要進(jìn)展:研究人員使用來自16個(gè)國家的6450名長新冠患者的數(shù)據(jù),找到了與長新冠相關(guān)的FOXP4基因(Forkhead Box P4,一種肺癌基因),該基因在肺部和其他器官及一些免疫細(xì)胞中活躍。該項(xiàng)研究于當(dāng)?shù)貢r(shí)間6月29日發(fā)表于預(yù)印本平臺medRxiv上。

研究人員希望這項(xiàng)分析只是一個(gè)開始,仍需要大量數(shù)據(jù)來解開像長新冠這樣復(fù)雜的疾病,它與 200多種癥狀有關(guān)。

據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)定義,長新冠指在最初的新冠病毒(SARS-CoV-2)感染3個(gè)月后繼續(xù)或出現(xiàn)新的癥狀,包括疲勞、呼吸短促和認(rèn)知功能障礙等,并且這些癥狀持續(xù)至少2個(gè)月。大約10%-20%感染SARS-CoV-2的人可能會(huì)繼續(xù)出現(xiàn)長新冠癥狀。

法國讓·莫內(nèi)大學(xué)(Jean Monnet University)免疫學(xué)家斯蒂芬妮·隆格特(Stéphanie Longet)說:“這些研究是更多地了解長期COVID原因的早期步驟。有幾個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)對患者至關(guān)重要,包括治療和預(yù)防,當(dāng)原因(可能是多因素)被清楚地了解時(shí),這將有助于治療更容易發(fā)展為長新冠并可能預(yù)防長新冠的患者。”

找到易感基因

三年來,全球COVID-19(新型冠狀病毒肺炎)宿主遺傳學(xué)計(jì)劃(COVID-19 HGI)一直在尋找與嚴(yán)重長新冠風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的DNA序列,目前正在進(jìn)行的搜尋工作已經(jīng)涉及參與免疫系統(tǒng)和允許SARS-CoV-2病毒進(jìn)入細(xì)胞的基因。卡羅林斯卡研究所的遺傳學(xué)家、預(yù)印本論文的主要作者雨果·澤伯格(Hugo Zeberg)介紹,這項(xiàng)長新冠研究是全球COVID-19宿主遺傳學(xué)計(jì)劃的衍生項(xiàng)目。其團(tuán)隊(duì)匯編了24項(xiàng)研究的數(shù)據(jù),涉及近6500名長新冠患者,以及100多萬名作為對照組的其他參與者。

據(jù)悉,全球COVID-19宿主遺傳學(xué)計(jì)劃由全球科學(xué)家于2020年3月成立,旨在與世界各地的研究小組共享科學(xué)方法和資源,以調(diào)查SARS-CoV-2感染的宿主遺傳決定因素和由此產(chǎn)生的COVID-19疾病的嚴(yán)重程度。

在一項(xiàng)綜合了其中11項(xiàng)研究數(shù)據(jù)的分析中,研究人員發(fā)現(xiàn),基因組的一個(gè)特定區(qū)域與患長新冠的幾率高出約1.6倍有關(guān),這段DNA靠近FOXP4基因。與長新冠相關(guān)的變異也與肺細(xì)胞中FOXP4的更高表達(dá)有關(guān)。

2021年7月,全球COVID-19宿主遺傳學(xué)計(jì)劃在《自然》雜志發(fā)表過一篇名為《繪制COVID-19的人類遺傳結(jié)構(gòu)》(Mapping the human genetic architecture of COVID-19)的論文,將FOXP4與新冠重癥的風(fēng)險(xiǎn)增加聯(lián)系起來。論文共報(bào)告了13個(gè)與SARS-CoV-2感染或新冠重癥相關(guān)的全基因組重要位點(diǎn),澤伯格及其同事發(fā)現(xiàn)其中一些位點(diǎn)也與肺癌有關(guān)。盡管新冠重癥會(huì)增加長新冠的風(fēng)險(xiǎn),但研究小組發(fā)現(xiàn),DNA變異對長新冠風(fēng)險(xiǎn)的貢獻(xiàn)太大,無法僅用它與新冠重癥的聯(lián)系來解釋。澤伯格說,“這種變異對長新冠的影響要比對(新冠)嚴(yán)重程度的影響大得多。”

未來長新冠遺傳風(fēng)險(xiǎn)因素列表可能增加

在其他數(shù)據(jù)集中復(fù)制這一發(fā)現(xiàn)將有助于加強(qiáng)研究的結(jié)論,美國圣猶達(dá)兒童研究醫(yī)院(St. Jude Children’s Research Hospital)的生物信息學(xué)家程中山指出,長新冠分析中使用的許多數(shù)據(jù)也用于發(fā)現(xiàn)FOX4P與新冠重癥之間存在聯(lián)系的分析。新的數(shù)據(jù)將有助于排除其他因素(如肺癌)影響與FOX4P的明顯聯(lián)系的可能性。

FOXP4僅僅是導(dǎo)致長新冠的一個(gè)因素,盡管如此,程中山說,“這項(xiàng)研究仍然是一個(gè)突破,未來的研究可能會(huì)增加已知的長新冠的遺傳風(fēng)險(xiǎn)因素列表。”

英國愛丁堡大學(xué)(University of Edinburgh)醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)教授克里斯·龐廷(Chris Ponting)表示,“這不僅僅是一個(gè)單一的答案,人們的各種弱點(diǎn)都會(huì)導(dǎo)致他們無法從新冠中恢復(fù)過來。”

龐廷和他的同事們提出了一項(xiàng)研究,將包括1.5萬名長新冠患者的DNA。但他說,撥款審查者拒絕了他們的研究提議,因?yàn)殚L新冠太復(fù)雜,無法用龐廷團(tuán)隊(duì)建議的方式進(jìn)行剖析。但龐廷認(rèn)為,“盡管這非常復(fù)雜,但剖析也非常重要,因?yàn)殚L新冠的健康和社會(huì)經(jīng)濟(jì)成本是巨大的,并不是每個(gè)患者都能如愿康復(fù)。”

參考資料:

1.https://www.nature.com/articles/s41586-021-03767-x

2.https://www.nature.com/articles/d41586-023-02269-2

    責(zé)任編輯:盧雁
    圖片編輯:樂浴峰
    校對:施鋆
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