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英國最新通報:猴痘經性網絡擴散, 病毒基因突變或增強耐藥性
本輪蔓延全球的猴痘疫情始現于英國, 而英國也是目前猴痘確診病例數最多的國家。當地時間6月10日, 英國衛生安全局(UKHSA)公布了關于英國猴痘疫情的第一份技術性簡報。
這份報告包括了英國最新的猴痘流行病學數據,對患者的匿名詳細訪談信息, 暴發病毒與此前猴痘病毒之間基因組差異的初步評估等重要內容,將有助于全球衛生機構進一步了解猴痘的傳播并采取針對性的干預措施。
根據報告, 受訪的英國猴痘病例中, 99%的患者為30-40歲男性, 不少患者在4月已經開始出現癥狀。地理性、多渠道的性網絡擴大了猴痘病毒的傳播。猴痘病毒基因組中出現的突變可能對病毒蛋白質的功能產生影響, 包括可能使病毒的耐藥性增強。
此外, 報告將此次猴痘疫情可能的傳播分成了四個級別, 并將英國目前的情況劃定為2級, 即“在具有大量密切接觸者的確定性亞群中的傳播”。英國衛生安全局表示, 正在密切監測任何可能提升至3級——“在多個亞群或更大亞群中的傳播”的證據。
根據美國疾病預防與控制中心的數據, 截至6月11日, 全球累計確診猴痘病例1472例, 英國已確診猴痘病例達366例。
英國衛生安全局臨床和新發感染主任米拉·錢德(Meera Chand)博士說, “英國政府正在跟全球合作伙伴共同努力,推進我們所需的調查,以幫助我們更好地了解猴痘病毒及其傳播, 推動疫苗和治療等緩解措施。這些新數據也能為公共衛生部門應對疫情的工作提供信息,從而進一步減少傳播。”
他說,這次爆發疫情的許多方面還需要進一步調查。目前英國衛生安全局已經召集了一個由公共衛生、國民醫療服務體系和學術伙伴組成的專家組,開展了全面的調查工作。其結果將在隨后的技術簡報中公布。
性網絡傳播讓疫情防控挑戰機遇并存
報告稱, 自2022年5月6日起,英國確認了猴痘感染病例。截至2022年6月8日,英國共有336例實驗室確診病例,其中英格蘭320例。患者中大部分沒有到猴痘流行國家的旅行記錄。
上圖表示截至2022年6月8日,按癥狀發作日期分列的英國猴痘確診病例發生數量
在英格蘭的病例中,81%是倫敦居民。在可獲得性別信息的情況下,311例(314例中99%)確診病例為男性,3例為女性。英國確診病例的中位年齡為38歲。
152例病例參與了更詳細的問卷調查, 152名受訪男性中,有151人認為自己是同性戀、雙性戀和其他與男性發生性關系的男性(GBMSM),或者有過同性性接觸。有75例(22%)報告在癥狀出現前21天內最近出國旅行,其中59例報告在歐洲境內旅行。
調查者重點關注了病例的性健康情況,截至2022年5月25日,在發現的82例已知或疑似與GBMSM性網絡傳播有關的病例中,研究者對其中45例(55%)使用了更具體詳細的問卷進行了重新訪談。
這些患者的癥狀出現日期為2022年4月8日至5月20日,所有病例均在2022年5月確診。調查者在對患者發病、旅行和參加活動日期的分析發現,31例(占45例中的69%)未出國旅行的受訪病例從2022年4月起出現癥狀。
報告指出,調查結果表明,猴痘是通過在地理上擴散的性網絡傳播的。幾乎所有(98%)受訪病例都報告在潛伏期(5至21天)與其他男性發生過性關系。大多數人(45例中的60%)在一年前被診斷為性傳播感染,44%(45人中的20人)報告在前3個月有10名以上的性伴侶,44%(45人中的20人)報告在潛伏期發生了集體性行為。本次疫情涉及的性網絡覆蓋到英國國土內外,30%(45例中有13例)報告在居住地以外的城市發生過性行為,20%(45例中有9例)報告在英國國外發生過性行為,24%(45例中有11例)報告在潛伏期與非英國居民的男性發生過性行為。
報告指出, 這種傳播途徑將給疫情防控同時帶來挑戰和機遇 。“針對這一特定群體,如果要將傳統的接觸追蹤作為主要的控制干預措施,將面臨著一定困難,因為大多數病例都報告了與新的或偶然的伴侶有性接觸,通常無法追蹤到接觸細節。”
但另一方面,英國認為防控的機遇和可能性也并不是沒有:首先,英國性健康服務中心(Sexual health services,SHS)能夠成為實施控制干預措施(如疫苗)的潛在環境,因為有感染風險的人與這些服務中心之間已經建立了聯系。例如,45個被調查病例中大多病例的艾滋病毒檢測陰性,因為他們中很多(32人中有29人)在SHS接受著艾滋病毒暴露前預防措施干預,而所有感染艾滋病毒的病例在這些中心接受治療。
其次, 在接受采訪的人中,44%(45人中有20人)表示在潛伏期去過英國或國外的性場所,比如桑拿房或性俱樂部。因此,與性場所合作實施有針對性的干預措施將有助于疫情控制。
再次, 調查顯示, 在病例中,地理空間約會手機應用的使用率很高,64%(45例中有28例)的病例都報告稱,在其病情潛伏期內使用這類手機應用結識了新的伴侶,這表明這些應用也可能成為傳播健康信息的有用平臺, 并通過應用創新方法來追蹤接觸者。
不過報告指出, 這項早期的快速性健康問卷調查的結果有一些局限性。由于病毒傳播模式有可能發生演變,這些發現或許不能代表疫情的全部清空。因此,正在進行的案例訪談分析或許將表明這些模式是否正在改變。
病毒基因突變或導致病毒耐藥性增強
英國衛生安全局的報告指出,相對于其它病毒的基因組測序,猴痘病毒基因組測序存在著特殊的困難。
猴痘病毒基因組由兩條脫氧核糖核酸(DNA)鏈組成,長度約為197kb,堿基對中鳥嘌呤-胞嘧啶含量(GC)平均為33%。基因組包含190個編碼序列,有一個中心區域,附屬基因組位于基因組末端,在每個末端都有一個典型的倒置重復序列(長約6.5kb)。
報告指出,猴痘特殊的基因組結構對基因組的精確重建提出了挑戰,倒置的串聯重復序列使得很難使用短序列比對(short reads)方法測序。基因組的低鳥嘌呤-胞嘧啶含量會導致PolyA/T結構(連續的AT堿基對),從而難以精確測序。此外,局部串聯的重復序列分散在基因組中,這也會對測序帶來挑戰。
準確的基因組重建依賴于足夠深度和廣度的覆蓋。到目前為止,研究者主要是通過宏基因組測序方法對猴痘病毒基因組序列進行測序。宏基因組學方法生成有用序列的可行性,通常受到樣本中宿主與病毒基因讀碼數比例的限制,非常深入的測序或許可以部分緩解這一問題。
此前,全球多個國家的研究團隊已經公布了猴痘病毒基因組的測序報告,并指出了猴痘病毒核苷酸的變異數量超乎預期。而英國衛生安全局的這份報告,首次將猴痘病毒基因的變異跟病毒蛋白質的功能改變建立了關聯。
報告稱,與2018年在英國發現的猴痘病毒株相比,目前的英國猴痘病毒株在其基因組中包含了48個單一突變。其中27個突變是同義突變,不會改變病毒蛋白質,而另外21個突變則會導致病毒蛋白質的變化。
根據病毒蛋白的已知功能,研究者將這些突變分為低、中、高優先級,評估基于從病毒中完全刪除這些蛋白質帶來的影響。但研究者稱,目前尚無法預測單個基因突變與完全蛋白質缺失之間的差異。
分析結果顯示,在21個突變中,有2個低優先級的突變:C9L(R48C),一種干擾素激動劑,刪除時病毒在干擾素存在下復制能力會變得更差;A46L(H221Y),一種毒力因子,刪除時可降低病毒在小鼠體內的毒力。
4個中等優先級突變:C23L(S105L),趨化因子結合蛋白,刪除時會增加兔子患病時的嚴重程度;C22L(S54F), 腫瘤壞死因子(TNF) ,刪除時可增加小鼠肺部病理;C19L(D266N),錨蛋白重復蛋白(功能未知,可能是宿主范圍或毒性) 。
在中等優先級突變中,特別值得注意的是F13L(E353K) ,這是抗病毒藥物特考韋瑞(Tecovirimat)的靶點。作為一種治療天花的抗病毒藥物,Tecovirimat是目前唯一一種被美國FDA允許的治療猴痘的藥物。已有研究已經證明,F13L(G277C)的單個突變將導致病毒對Tecovirimat耐藥性的產生。
有3種突變存在于一種蛋白質中,被列為高優先級: B21/B22(D209N, P722S, M1741I): 這是一種T細胞抑制劑,也存在于牛痘病毒、駱駝痘病毒和馬痘病毒中,將該蛋白敲入非毒性牛痘株中會增加大鼠的疾病嚴重程度和死亡率。
而最后報告也謹慎地表示,本輪猴痘病毒的突變基因分布于整個基因組,其導致的一小部分蛋白質突變與病毒傳播、毒性或與抗病毒藥物相互作用有關, 但需要后續結構建模來評估單個突變對蛋白質的影響。
報告表示,在后續的研究中,研究團隊還會對包括無癥狀感染者的水平、病毒動力學、疫苗反應和免疫、藥物接觸后預防、早期治療和傳播風險、隔離日期、媒體報道行為和偏見、感染的長期后果等方面做出進一步調查。
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