5月20日，傳染病預(yù)防控制國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室公眾號(hào)刊登一篇題為《新冠肺炎重癥患者鼻咽部過(guò)度生長(zhǎng)的“超級(jí)優(yōu)勢(shì)致病性共生菌屬”可下行到肺部致病》的文章，稱研究發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2重癥患者的鼻咽微生物群多樣性喪失，且增長(zhǎng)占比超過(guò)50%的鼻咽部細(xì)菌——超級(jí)優(yōu)勢(shì)菌（Super-dominant Pathobiontic Bacteria，SDPG），可在疾病發(fā)展進(jìn)程中侵入下呼吸道，導(dǎo)致患者出現(xiàn)繼發(fā)性細(xì)菌性肺炎。

文章指出，若要減少新冠患者的重癥率和死亡率，要考慮超級(jí)優(yōu)勢(shì)菌的存在，并關(guān)注鼻咽部菌群失調(diào)問(wèn)題。

中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院學(xué)部委員、中國(guó)工程院院士、南開大學(xué)公共衛(wèi)生與健康研究院院長(zhǎng)、中國(guó)微生物學(xué)會(huì)理事長(zhǎng)、傳染病預(yù)防控制專家徐建國(guó)向澎湃新聞（www.6773257.com）表示，過(guò)度生長(zhǎng)的致病共生菌往往對(duì)多種抗生素耐藥，給治療帶來(lái)困難，是重癥和死亡的重要原因。“許多病毒性傳染病是始于病毒‘亡’于細(xì)菌，譬如甲流，我們對(duì)這一點(diǎn)忽略了。”

該文章援引的研究論文近期發(fā)表于《Spectrum Microbiology》雜志，題為《鼻咽部微生物群中的超級(jí)優(yōu)勢(shì)病原菌導(dǎo)致COVID-19患者二次細(xì)菌感染（Super Dominant Pathobiontic Bacteria in the Nasopharyngeal Microbiota Cause Secondary Bacterial Infection in COVID-19 Patients）》。第一作者為中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病所研究員秦天，傳染病所徐建國(guó)院士為責(zé)任作者。

健康人的鼻咽部包括兩類細(xì)菌，一類是健康共生菌，一類是致病共生菌。致病共生菌在正常情況下和人共生，但具有致病潛力；在宿主免疫力低下等條件下，可導(dǎo)致疾病發(fā)生，也稱“兩面菌（two face bacteria）”。

超級(jí)優(yōu)勢(shì)致病性共生菌屬（SDPG），指在流感病毒患者鼻咽部的致病共生菌（Pathobionts）過(guò)度增長(zhǎng)，豐度（數(shù)量）占比超過(guò)菌群細(xì)胞總數(shù)50%的致病性菌屬。

該研究團(tuán)隊(duì)對(duì)20例重癥和51例輕癥新冠患者開展上下呼吸道細(xì)菌宏分類學(xué)研究后發(fā)現(xiàn)，新冠肺炎輕度和重度患者的SDPG數(shù)量存在顯著差異。在輕癥患者中，10.8%的鼻咽部菌群和8.5%下呼吸道菌群有SDPG，沒有患者在這兩個(gè)區(qū)域同時(shí)出現(xiàn)SDPG。而在重癥患者中，40.7%的鼻咽部菌群和63.2%的下呼吸道菌群有SDPG，其中30%重癥患者，從鼻咽拭子和肺泡灌洗液標(biāo)本分離菌株的基因組序列完全一致，這說(shuō)明這些超級(jí)優(yōu)勢(shì)致病共生菌可在疾病發(fā)展進(jìn)程中，從鼻咽部下行到肺泡造成感染，導(dǎo)致重癥或者死亡。

對(duì)SARS-CoV-2輕重癥患者上呼吸道和下呼吸道樣本的測(cè)序結(jié)果。MU指的是輕度COVID-19輕癥患者的上呼吸道；MD指COVID-19輕癥患者的下呼吸道；SU指COVID-19重癥患者的上呼吸道；SD指COVID-19重癥患者的下呼吸道

在新冠肺炎患者中發(fā)現(xiàn)具有下行能力的細(xì)菌包括，鮑曼不動(dòng)桿菌、金黃色葡萄球菌、紋狀體棒狀桿菌等。其中，葡萄球菌、棒狀桿菌和不動(dòng)桿菌是主要的SDPG。

對(duì)此，該研究認(rèn)為，SARS-CoV-2重癥患者的鼻咽微生物群多樣性喪失，鼻咽微生物群中的SDPG可導(dǎo)致新冠重癥患者出現(xiàn)繼發(fā)性細(xì)菌感染，并加重肺炎，導(dǎo)致高死亡率。事實(shí)上，繼發(fā)性細(xì)菌感染，是目前病毒性肺炎（例如流感）重癥化，乃至導(dǎo)致死亡的最重要、最直接的原因之一。

澎湃新聞?dòng)浾咦⒁獾剑旖▏?guó)團(tuán)隊(duì)也曾發(fā)表相關(guān)針對(duì)繼發(fā)性下呼吸道細(xì)菌感染的研究論文，提出超級(jí)優(yōu)勢(shì)菌可在疾病發(fā)展進(jìn)程中下行到肺泡造成感染，導(dǎo)致死亡。

該論文題為“鼻咽部超級(jí)優(yōu)勢(shì)菌是流感患者繼發(fā)細(xì)菌感染的原因（Super-dominant Pathobiontic Bacteria in the Nasopharyngeal Microbiota as Causative Agents of Secondary Bacterial Infection in Influenza Patients）”，于2020年發(fā)表于期刊雜志《Emerging Microbes & Infections》。第一作者為中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病所研究員秦天，協(xié)和醫(yī)院李太生主任、傳染病所徐建國(guó)院士為責(zé)任作者。

為了證實(shí)鼻咽部超級(jí)優(yōu)勢(shì)菌可下行到肺泡的理論，該研究團(tuán)隊(duì)基于2017-2018年北京流感大流行期間的樣本開展對(duì)照試驗(yàn)，利用16SrRNA基因V3-V4區(qū)域的高通量測(cè)序分析鼻咽部微生物群的分類組成。

研究人員從患者的咽拭子和肺泡灌洗液分離細(xì)菌后發(fā)現(xiàn)，61% 的重癥患者、24%的輕癥患者和29%健康人鼻咽部菌群具有SDPG。

同一患者，從鼻咽部和肺泡分離的菌株的基因組序列完全一致。也就是說(shuō)，患者鼻咽部的超級(jí)優(yōu)勢(shì)致病性共生菌屬可下行到肺泡，造成肺部感染。研究發(fā)現(xiàn)具有下行能力的細(xì)菌包括鮑曼不動(dòng)桿菌、肺炎克雷伯菌、銅綠假單胞菌、紋狀體棒狀桿菌等。

從患者鼻咽部和肺泡灌洗液分離菌株的PFGE圖譜及基因組相同，圖源：傳染病預(yù)防控制國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室網(wǎng)站

秦天對(duì)此認(rèn)為，許多細(xì)菌是“兩面菌”，在一定的條件下可轉(zhuǎn)化為致病菌，是醫(yī)學(xué)細(xì)菌學(xué)研究的新課題。而責(zé)任作者之一，協(xié)和醫(yī)院李太生主任則表示，這個(gè)現(xiàn)象可能具有普遍意義，或?qū)π滦凸跔畈《痉窝椎闹委熡袇⒖家饬x。

目前，新冠疫情發(fā)展態(tài)勢(shì)仍未明朗。在南非發(fā)現(xiàn)奧密克戎變異株6個(gè)月后，擁有顯著免疫逃逸能力的一系列亞變體——BA.2、BA2.12.1、BA.4和BA.5正掀起新的疫情浪潮。

加州大學(xué)洛杉磯分校公共衛(wèi)生學(xué)院流行病學(xué)系系主任張作風(fēng)此前向澎湃新聞分析稱，三個(gè)新亞型的傳染性比BA.1和BA.2強(qiáng)，對(duì)免疫系統(tǒng)穿透率也比較高，但由于病毒停留在上呼吸道，大多不攻擊肺部，所以對(duì)重癥率和病死率的影響有限。

“新冠疫情發(fā)展到現(xiàn)在，防重癥、防死亡成為重中之重。”徐建國(guó)院士向澎湃新聞指出，鼻咽部菌群紊亂，一些細(xì)菌過(guò)度生長(zhǎng)，數(shù)量上占絕對(duì)優(yōu)勢(shì)。這些過(guò)度生長(zhǎng)的致病共生菌，會(huì)有更多的機(jī)會(huì)，下行到肺泡，成為主要病原體，導(dǎo)致死亡，“它們往往對(duì)多種抗生素耐藥，給治療帶來(lái)困難，是重癥和死亡的重要原因，但過(guò)去我們并不知道這一點(diǎn)”。

徐建國(guó)院士表示，在與協(xié)和醫(yī)院李太生主任醫(yī)師合作之下，該團(tuán)隊(duì)有機(jī)會(huì)同時(shí)比較患者鼻咽部和肺泡標(biāo)本的細(xì)菌——將李太生團(tuán)隊(duì)在患者入院時(shí)采集的鼻咽拭子分離的細(xì)菌，和患者住院后從肺泡標(biāo)本分離的細(xì)菌進(jìn)行比較，發(fā)現(xiàn)它們?cè)诨蚪M水平是一致的，“這個(gè)發(fā)現(xiàn)我們也非常吃驚，也坐實(shí)了我們的推論”。

對(duì)于目前新冠疫情的發(fā)展態(tài)勢(shì)，徐建國(guó)院士特別指出，老年人的基礎(chǔ)性疾病較多，免疫功能較低，發(fā)生菌群紊亂的可能性增大，這是自然現(xiàn)象，而目前還沒有調(diào)節(jié)鼻咽部菌群紊亂的制劑。他建議，老年患者注意口腔衛(wèi)生，常漱口，“漱口可不斷改變口腔細(xì)菌生長(zhǎng)的環(huán)境，或許能夠減少形成鼻咽部菌群紊亂的機(jī)會(huì)”。時(shí)，臨床醫(yī)生盡早關(guān)注鼻咽部菌群紊亂的問(wèn)題，關(guān)注SDPG的現(xiàn)象，采取對(duì)應(yīng)措施，預(yù)防SDPG的發(fā)生。

徐建國(guó)院士還呼吁科學(xué)家研究冠狀病毒和細(xì)菌相互作用的科學(xué)問(wèn)題，為疫情防控提供新的知識(shí)和產(chǎn)品。

“細(xì)菌和病毒差別較大，是兩個(gè)學(xué)科，特點(diǎn)不同，研究者往往分屬兩個(gè)團(tuán)隊(duì)。但細(xì)菌和病毒在人體是在一起的，包括鼻咽部、肺泡、腸道等。我們不應(yīng)該在研究時(shí)只看細(xì)菌，不看病毒，或者只看病毒，不看細(xì)菌。新冠是人類歷史上從來(lái)沒有遇到過(guò)的傳染病。防控新冠，我們需要新的思維，新的理論，新的產(chǎn)品，應(yīng)該具有整合醫(yī)學(xué)的理念，或許這是我們走出困境的一條思路。”他說(shuō)。