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我們真的可以“復(fù)活”已經(jīng)滅絕的猛犸象嗎?
我們真的可以“復(fù)活”已經(jīng)滅絕的猛犸象嗎? 原創(chuàng) 湛廬君 湛廬文化
每個人的生命邏輯都是一樣的。
——魏文勝
北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院研究員
博士生導(dǎo)師
有這樣一幅漫畫,漫畫中的母雞對鴨子說:“我保證生個鴨蛋。”我們當(dāng)然知道,不管它自己的意愿多么強(qiáng)烈,這都是不可能實(shí)現(xiàn)的。為什么呢?這就要說到受精卵的秘密了。
下圖中有3個受精卵,它們分別會成長為怎樣的個體?通過圖片可以看到,它們最后會發(fā)育成海膽、老鼠和海藻。當(dāng)它們還是單細(xì)胞的時候,不管從尺寸還是形狀,抑或其他各個方面,都很難區(qū)分彼此,但其內(nèi)部存在的遺傳密碼決定了其最終發(fā)育出的生命形態(tài)千差萬別。
01
我們的生命密碼
隨著人類基因組計劃的完成和高通量測序技術(shù)的發(fā)展,人們讀取大量序列信息的能力得到了飛速的提升。“讀”的能力提高進(jìn)一步激發(fā)了人們改寫生物體內(nèi)遺傳序列信息的需求,而近年來發(fā)展迅速的基因編輯技術(shù)又大幅提高了“寫”的能力。
基因編輯是一種特殊的生物技術(shù),能夠讓研究者對基因組序列或基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物進(jìn)行人為編輯,以改變目的基因,調(diào)控元件的序列、表達(dá)量或功能。
這一革命性技術(shù)一經(jīng)問世便使生命科學(xué)的各個研究領(lǐng)域受到震撼,它必將在未來相當(dāng)長時間內(nèi)對人類健康、疾病治療、新藥研發(fā)、物種改良以及生命科學(xué)基礎(chǔ)研究等諸多方面產(chǎn)生廣泛而深遠(yuǎn)的影響,基因編輯技術(shù)也是世界范圍內(nèi)競爭最為激烈的下一代核心生物技術(shù)。
決定受精卵發(fā)育后生命形態(tài)多姿多彩的因素雖然很復(fù)雜,但回溯到單細(xì)胞層面,背后的邏輯非常相似。
原因其實(shí)很簡單,人類的生命密碼組成基于一套完全一致的邏輯,即每個人的生命邏輯都是一樣的——比如我們都知道人體細(xì)胞中有46個染色體,具體的密碼是A-T、C-G,然后由它們4個排列組合而成。雖然作為基因,RNA蛋白是最主要功能的載體,使生命的形式呈現(xiàn)出了豐富多彩的樣子,但其背后底層的邏輯就是A-T、C-G的排列組合。
這也就是為什么任何基因的突變,甚至非常微小的突變,都可能導(dǎo)致各種遺傳病,甚至影響人的高矮胖瘦等外在表現(xiàn)。
我們通常認(rèn)為A-T、C-G這個組合有幾種改變方式,比如substitution(切換)、insertion(插入)以及deletion(刪除)。任何基因的突變,甚至非常微小的突變,都可能導(dǎo)致各種遺傳病,甚至影響人的高矮胖瘦等外在表現(xiàn)。
這里舉的是一個簡單的例子,但其實(shí)無論是阿爾茨海默病或是大腦的早衰,所有疾病的背后邏輯在分子層面上都可以是非常簡單的。這也是人類對基因組序列解讀抱有執(zhí)念的原因,而它也是我們研究生命密碼的根本。
對這些序列做一個類比,生命密碼是四進(jìn)制,A-T、C-G,十分簡單。在IT領(lǐng)域,所有代碼表達(dá)的信息背后,其邏輯基礎(chǔ)都是二進(jìn)制,不管是互聯(lián)網(wǎng)巨頭的觀點(diǎn),還是人們每天的聊天記錄,背后都是0101的序列,人類使用的高級語言雖然脫離了01,但本質(zhì)上還只是簡單元素的排列組合。
所以表面上看,01非常簡單,但通過它的排列組合能夠承載信息的復(fù)雜度、豐富程度卻往往超出我們的想象。A-T、C-G雖只是四進(jìn)制的,但承載的信息量很多,正是這個原因,使得生命非常豐富。
02
基因編輯的三個動作
生命如此復(fù)雜,從某些方面上看我們甚至覺得它永遠(yuǎn)不可能被超越,之所以如此,是因?yàn)槿祟悓ι行碌南敕ā?/p>
我們對序列有三個動作。
第一個動作是“讀”
我們要知道基因的序列是如何排列的,排列成什么樣子。想要知道這個,思路很簡單,就是測序。從最初的測序開始,在將近20年里,我們已經(jīng)把整個人類的基因組都測完了,只剩下了一點(diǎn)點(diǎn)。如果把它全部打印出來,在《自然》《科學(xué)》雜志上同時去發(fā)表,必然會裝訂出厚厚的一本書。
如果再花費(fèi)幾億美金,把剩余的部分測完,我們是不是就能夠獲知生命的所有信息以及所有秘密?不一定。但是,測序能為我們了解基因的功能做一個鋪墊。相對來說,“讀”是最簡單的。
第二個動作是合成,也叫“寫”
既然知道了序列是什么樣的、某個基因序列的排列是什么樣的,以及會形成什么突變并造成什么樣的問題,那么是不是就可以進(jìn)行人為的干預(yù)、合成或者組裝?
其實(shí),合成這件事情在我們的體內(nèi)一直存在。一個細(xì)胞會分裂成兩個細(xì)胞,它其實(shí)已經(jīng)在“讀”、已經(jīng)在“寫”了,而且它“寫”得非常精確。甚至,從一代到下一代的傳承上,基因也在進(jìn)行“寫”的動作——你的基因來自你的父母,而你的父母各自提供一半的遺傳信息,合在一起之后就形成了你的基因。
所以說,我們早就在無意識地做“寫”這件事了,而且每天都在做。但我們現(xiàn)在討論更多的是人為的“寫”,而化學(xué)合成的方法所能“寫”的長度,顯然遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于我們自身自然機(jī)制所能達(dá)到的長度——就拿一個細(xì)胞分裂成另外一個細(xì)胞這個“寫”的操作來說,任何一家公司即使花再多錢也是做不到的。
所以在“寫”這個動作上,研究難度已經(jīng)增加了。
第三個動作是編輯
不是要簡單地“讀”,也不是簡單地“寫”,而是要“改”。“寫”比較簡單,可以遵照人的知識,按照人的意愿把序列排列出來,然后合成。
而“編輯”就要求真的去修改了,這極具挑戰(zhàn)——這表明,我們可以在個體的細(xì)胞層面上對某些細(xì)胞或者某個細(xì)胞的一些密碼進(jìn)行隨心所欲的改變,所以為什么說難度最高,也是因?yàn)樵谶@個過程中,不是所有動作都能叫作“編輯”。而且從合規(guī)性方面來說,對這個技術(shù)的承認(rèn)也是一個很艱難的課題。
通常我們在講到基因編輯時會說到兩個關(guān)鍵詞:第一個是定位,因?yàn)锳-T、C-G長得一模一樣,只是排列組合不一樣,所以,如何精確地定位你要“寫”以及“編輯”的地方,這是最大的難題。
相比之下,第二個關(guān)鍵詞“編輯”反而不是挑戰(zhàn),因?yàn)樗褪悄愕膭幼鞅旧怼!熬庉嫛钡姆绞胶芏啵怯蓤?zhí)行動作的酶或其他物質(zhì)來完成的。在整個基因組中完成這樣一件事情,我們稱之為“基因編輯”。
為什么強(qiáng)調(diào)基因編輯?因?yàn)榛驇旌艽螅诨虻耐粞蟠蠛@铮胍_地找到要編輯的地方是一個非常大的挑戰(zhàn)。
整個科學(xué)界對基因編輯的愿景由來已久,但本文討論的內(nèi)容更加復(fù)雜、高級,也就是在所謂的高等智力體里,如何能夠按照自己的意愿做精準(zhǔn)的定點(diǎn)敲除或者修改。
大家可能聽說過基因治療法CRISPR,其實(shí)它只是一個最新的研究成果,更早的還有homing endomclease等各種各樣的基因治療法,只不過真正走進(jìn)千家萬戶的是CRISPR。
不管是用蛋白來識別DNA序列,還是CRISPR基因治療法用RNA來識別DNA,歸根結(jié)底都是要實(shí)現(xiàn)識別這件事,只是使用的角度不一樣。
為什么我們想做到準(zhǔn)確的定位?是因?yàn)槲覀兿胱鼍庉嫻ぷ鳌6欢ㄎ痪蜔o法編輯,也無法確定應(yīng)該編輯什么。之所以很想做編輯這一工作,是源于我們很想按照自己的意愿來對世界做一些精準(zhǔn)的改變。
生命科學(xué)領(lǐng)域的研究者中,每個人每天做的研究都截然不同,但是大部分實(shí)驗(yàn)的工作原理是相通的,并會在幾個問題層面上進(jìn)行拓展研究:
基因的用處是什么?研究發(fā)現(xiàn)呈現(xiàn)出了什么問題?基因背后的分子邏輯是什么?
事實(shí)上,所有研究者都一直想建立一個因果關(guān)系——只有知道了基因的前因后果,才可能在疾病治療的改善上精進(jìn),才能夠讓糧食增產(chǎn),才能讓家畜變得精瘦。所以說,研究生命科學(xué)在某種程度上來看是最“功利”的。
基因科學(xué)的研究對象包括秀麗線蟲、果蠅,更高級的包括小鼠、斑馬魚、猴子等生物,那么為什么要研究這些生物?原因是,科學(xué)家可以通過它們來進(jìn)行遺傳學(xué)研究——現(xiàn)有的技術(shù)已經(jīng)能夠支持我們干凈利索地對它們的某些基因進(jìn)行編輯,然后建立起更好的因果模型。而對這些生物以及模型的研究,最終也是為了研究人類本身。
如果想實(shí)現(xiàn)基因編輯,那么我們不只需要這個技術(shù)本身,還需要掌握生物信息學(xué)的相關(guān)知識。如果我們能建立起基因之間的因果關(guān)系,那么就能夠迅速地找到很多關(guān)鍵問題的答案,比如:基因編輯除了高通量以外,還能做什么?
從某種意義上說,基因編輯技術(shù)能推動很多關(guān)鍵突破。比如,在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)上面,基因編輯技術(shù)可以讓蘑菇變成黃色的。又比如,我們都知道,蘋果在被咬下一口之后,剩下的部分會發(fā)生氧化,我們就可以通過基因編輯來干預(yù),以不讓它發(fā)黃、發(fā)褐,或者發(fā)黑。基因編輯技術(shù)還可以幫助養(yǎng)殖出瘦肉型的家畜。
甚至,未來有一天我們還可以“復(fù)活”已經(jīng)滅絕的猛犸象。
(注:以上內(nèi)容摘自
《那些比答案更重要的好問題》)
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原標(biāo)題:《我們真的可以“復(fù)活”已經(jīng)滅絕的猛犸象嗎?》
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